Margarida Sequeira foi Professora na Escola de Música e Presidente da Direção da SFUA.
Em 1995 foi eleita, juntamente com José Hilário Costa, para um cargo no âmbito da Federação Portuguesa de Bandas Filarmónicas.
Em 1997, dirigiu o Grupo Juvenil da Escola de Música da SFUA.
Em 1999, foi a primeira mulher eleita Presidente da Direção da coletividade.
Em 2000, demitiu-se do cargo de Presidente da Direção e da Escola de Música, assumindo as suas funções Carlos Oliveira.